近日,上海序禎達(dá)生物科技有限公司(以下簡稱:序禎達(dá)生物)實(shí)驗(yàn)室在華大智造DNBSEQ-T7平臺(tái)上完成了Olink Explore HT產(chǎn)品的適配驗(yàn)證,實(shí)驗(yàn)及測(cè)序后的數(shù)據(jù)經(jīng)過Olink Proteomics(以下簡稱:Olink)官方驗(yàn)證,得到了100%樣本通過QC的好成績,標(biāo)志著Olink蛋白組學(xué)與DNBSEQ平臺(tái)兼容取得了新進(jìn)展,也意味著DNBSEQ-T7平臺(tái)成功拓展蛋白組學(xué)應(yīng)用。通過序禎達(dá)生物、Olink、華大智造三方的合作,為終端用戶帶來了更多的選擇和更好的使用體驗(yàn)。
圖1. Olink Explore HT檢測(cè)實(shí)驗(yàn)流程圖(測(cè)序平臺(tái):DNBSEQ-T7)
驗(yàn)證內(nèi)容
本次驗(yàn)證采用了66例健康男性及66例健康女性的血漿樣本,通過Explore HT標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)流程進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)并完成了文庫構(gòu)建,使用MGIEasy Olink文庫環(huán)化套裝將文庫環(huán)化后上機(jī)DNBSEQ-T7平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序(測(cè)序策略:SE66,測(cè)序時(shí)間約5小時(shí)),同時(shí)在其原有測(cè)序平臺(tái)上機(jī)測(cè)序,通過比較NPX值的分布情況對(duì)不同平臺(tái)的產(chǎn)出效果進(jìn)行對(duì)比,結(jié)果如下:
圖2. 不同測(cè)序平臺(tái)NPX值分布的對(duì)比
Olink Explore HT文庫在DNBSEQ-T7與原有平臺(tái)的NPX值分析對(duì)比結(jié)果顯示兩個(gè)平臺(tái)的結(jié)果具有極高的一致性。
此外,驗(yàn)證還選擇了12例已知的在性別間顯著差異表達(dá)的蛋白來驗(yàn)證DNBSEQ-T7平臺(tái)產(chǎn)出的結(jié)果。其中包括了一些在生殖發(fā)育中承擔(dān)重要作用的蛋白, 如INSL3、EDDM3B 和 TEX101。結(jié)果發(fā)現(xiàn)這12種蛋白的濃度在男女樣本的濃度均與經(jīng)驗(yàn)結(jié)果一致,同時(shí)在DNBSEQ-T7及原有平臺(tái)上檢測(cè)這些蛋白時(shí)獲得了高度一致的結(jié)果(如下圖)。
圖3. 部分男女間差異蛋白在DNBSEQ-T7的NPX值以及不同平臺(tái)的檢測(cè)結(jié)果比較
關(guān)于三方合作的序禎達(dá)生物Olink蛋白組學(xué)平臺(tái)
從2021年序禎達(dá)生物與Olink建立合作伙伴關(guān)系,并成為Olink在中國的首批合作實(shí)驗(yàn)室之一,序禎達(dá)生物開始采用Olink專有的鄰位延伸分析技術(shù)(Proximity Extension Assay, PEA),賦能端對(duì)端的多組學(xué)臨床研究,以加速中國精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展進(jìn)程。2023年,序禎達(dá)生物與華大智造簽署了戰(zhàn)略合作協(xié)議,拓展了原有測(cè)序模式的可及性。
序禎達(dá)生物也是國內(nèi)首家可提供Olink Explore、Target、Flex及Focus全系列產(chǎn)品的服務(wù)商,是國內(nèi)首家通過Olink Target 48/96和Olink Explore質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)的一致性驗(yàn)證的服務(wù)商,一直以來致力于提供滿足國際標(biāo)準(zhǔn)的高質(zhì)量的檢測(cè)數(shù)據(jù)和服務(wù)。在Olink項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)方面,已成功滿足超過23種樣本的檢測(cè)服務(wù),Olink Explore平臺(tái)檢測(cè)樣本數(shù)也已達(dá)數(shù)萬例,無論是檢測(cè)經(jīng)驗(yàn)還是交付質(zhì)量,均處于國內(nèi)領(lǐng)先地位。
序禎達(dá)生物創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官孫樂樂博士表示:“序禎達(dá)生物是一家專業(yè)提供測(cè)序技術(shù)服務(wù)和多組學(xué)研究解決方案的服務(wù)型平臺(tái)企業(yè),多年來一直追求卓越的質(zhì)量控制標(biāo)準(zhǔn),擁有多臺(tái)高通量測(cè)序儀,在測(cè)序服務(wù)方面一直走在行業(yè)前列。序禎達(dá)生物也是Olink國內(nèi)首家服務(wù)商,2022年成為首家通過Olink Target 48/96和Olink Explore一致性驗(yàn)證的中國服務(wù)商,今年年初,又率先通過了Olink Explore HT檢測(cè)的國內(nèi)外實(shí)驗(yàn)室一致性驗(yàn)證評(píng)估且獲得了國內(nèi)首家官方認(rèn)證,是Olink國內(nèi)的具備國際質(zhì)量的服務(wù)商。很榮幸在序禎達(dá)生物的平臺(tái)可以見證Olink Explore數(shù)據(jù)能在華大智造的DNBSEQ-T7上產(chǎn)出且通過官方的QC認(rèn)證,未來,多組學(xué)、測(cè)序?qū)⒂懈嗟目赡苄裕屛覀児餐诖!?/span>
華大智造副總裁、中國區(qū)總經(jīng)理彭歡歡表示:“此前,我們對(duì)DNBSEQ-T7的性能進(jìn)行了全面升級(jí),通量更高、速度更快、數(shù)據(jù)質(zhì)量更佳,全方位賦能多組學(xué)研究發(fā)展。此次適配,將助力序禎達(dá)生物為其客戶提供更優(yōu)質(zhì)、更高效、更專業(yè)的技術(shù)檢測(cè)服務(wù),為蛋白組技術(shù)及應(yīng)用的發(fā)展注入強(qiáng)大動(dòng)力。”