單細胞測序技術解決了細胞異質性問題，極大地提升我們對生命系統認知的分辨率，已經成為生命科學研究的常規手段。特別是在腫瘤和疾病領域，單細胞提供了對各種疾病機制的全新見解，為靶點發現、鑒定以及Biomarker改進提供了全新助力。

回顧單細胞測序技術的發展歷史，細胞通量不斷提升，單個細胞成本快速降低。在過去5年，發展出以微液滴和微孔板技術為代表的商業化單細胞平臺，一次可以在單個樣本中實現上萬個細胞捕獲。特別是國產單細胞測序平臺的崛起，大大降低了建庫成本，但樣本前處理+建庫+測序+數據分析各項環節的綜合成本依然不菲，特別是單細胞組學測序數據量大，同樣是成本制約的關鍵因素。華大智造DNBSEQ-T7測序儀可在24小時內完成測序任務，適配國產單細胞平臺進一步加速解決單細胞測序費用高、測序速度慢的難題。

測試方案

測序質量和產出對比

DNBSEQ-T7平臺測序數據量產出平均值31.25G，測序質量上Q30平均值達到84.8%，達到了預期的測序數據量，高質量數據用于單細胞下游數據分析更加準確可靠。

單細胞數據指標對比

對測序下機數據進行質控、數據拆分、比對分析和Cell Calling，得到基礎數據指標例如細胞捕獲率、mapping率以及基因檢出情況，其中捕獲細胞數3410個，符合上機細胞捕獲預期，平均基因中位值796（低深度測序）。取單細胞高變基因top 3000進行了表達相關性分析，皮爾遜系統均大于0.99以上，證明Well-Paired-Seq單細胞平臺產生的文庫兼容DNBSEQ-T7測序平臺。

數據質控

單細胞數據分析前需要進行質控來濾掉低質量的細胞，從而獲得高質量的單細胞數據，例如對細胞中的counts值、檢測到的基因數、線粒體基因比例等進行調整。如下圖所示，分別對4組PBMC樣本進行如上調整，同時采用DoubletFinder算法來檢測并去除樣本中的雙細胞率從而獲得高質量的單細胞數據用于細胞分群及注釋等下游分析。

細胞分群比例統計

對4組數據進行單細胞多樣本整合分析，結果表明不同實驗批次的結果有非常好的分群重疊擬合，并且在細胞分群比例上基本保持一致，采用SingleR算法進行細胞分群注釋，得到了T細胞、B細胞、NK細胞等。不僅證明了Well-Paired-Seq平臺在不同實驗批次上的穩定性，產生的文庫適配DNBSEQ-T7測序平臺，呈現穩定一致的結果。

測評總結

華大智造DNBSEQ-T7在Well-Paired-Seq平臺生成的文庫測序中表現穩定且數據質量高，可滿足用戶單細胞下游數據分析的各項需求，如細胞類型注釋、差異表達分析、功能富集分析、細胞間相互作用分析等。

值得一提的是，基于華大智造獨有的DNBSEQ測序技術，超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7日產出高質量數據可達1-7TB，是當前全球日生產能力最強的基因測序儀之一。DNBSEQ-T7超強的日生產能力支持全基因組測序、超深度外顯子組測序、表觀基因組測序、轉錄組測序、單細胞測序、腫瘤Panel等大型測序項目。