在植物生物學的領域中,細胞間的異質性研究已成為解鎖植物生長發育復雜機制的關鍵鑰匙。華大智造DNBelab C系列單細胞一站式平臺包含從樣本保存、樣本制備、文庫制備、上機測序到數據分析的全流程工具,在多個熱門研究領域具有廣泛的應用,尤其在植物領域取得了顯著成果。開泰生物擁有成熟和穩定的原生質體制備方案,搭配DNBelab C-TaiM 4單細胞液滴生成儀和DNBSEQ-T7超高通量測序平臺,為水稻莖部組織的單細胞研究提供了高效、精準、全面的解決方案。
華大智造DNBelab C系列單細胞一站式平臺
01材料與方法
02實驗流程
開泰生物植物單細胞的實測數據展示
1.高數據產出:
在DNBelab C-TaiM 4的精準單細胞捕捉與DNBSEQ-T7的高通量測序平臺雙重賦能下,對兩個水稻樣本提原生質體進行單細胞實驗,從質控數據結果顯示:兩個樣本生物學重復較好,并展現出了極高的產出量和良好的質量,細胞捕獲數均在8,000左右,基因檢出數都在1,900左右,充分驗證了該實驗方案的穩定性和可靠性。
2.細胞分群和鑒定:
細胞聚類分群后,通過已發表文章查找Marker基因、搜索水稻數據庫,注釋鑒定出9種細胞群,完成了水稻莖單細胞圖譜構建,細胞類型詳見UMAP圖。
測評總結
在開泰生物基于DNBelab C-TaiM 4平臺進行的植物水稻莖部組織的單細胞檢測的研究中,無論從水稻莖部組織原生質體的質量、單細胞測序實驗結果數據的穩定性和可重復性、還是基因的檢出數方面均表現優異。作為支持該研究的核心技術平臺,DNBelab C系列產品以其強大的兼容性和高效性為科研工作者提供穩定和可靠的數據產出,極大地提升了科研工作的效率和準確性。
開泰生物作為華大智造DNBelab C系列高通量單細胞RNA文庫制備認證服務商,長期專注于高通量單細胞多組學的技術研發與服務,在植物單細胞的研究中具有豐富經驗,尤其是植物原生質體制備。目前成功解離了近千例植物組織樣本,建立20+植物、30+組織部位的原生質體制備體系。