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時空可視化試劑套裝

華大智造時空可視化試劑套裝是專為STOmics時空組學文庫設計的試劑套裝,該試劑套裝使用聯(lián)合探針錨定聚合技術(cPAS),通過將DNA分子錨和熒光探針在DNA納米球(DNB)上進行聚合,并利用高分辨率成像系統(tǒng)對光信號進行采集,光信號經過數字化處理獲得高質量高準確度的樣本序列信息。搭配時空組學的建庫流程,基于可視化試劑套裝,華大智造DNBSEQ-T7RS和MGISEQ-2000RS測序平臺為時空組學文庫提供卓越的測序性能,并助力Stereo-seq時空組學技術解決更多的科學問題。



時空可視化試劑套裝

DNBSEQ-T7RS 時空可視化試劑套裝(T7 STO FCL PE75)

貨號:940-001895-00
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MGISEQ-2000RS 時空可視化試劑套裝(G400 STO FCL PE75)

貨號:940-001887-00
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產品特點

雙平臺適配
雙平臺適配
搭配時空組學建庫流程,適配DNBSEQ-T7RSMGISEQ-2000RS,提供卓越的測序性能
一體化集成
一體化集成
高度集成試劑盒,內置時空測序引物和一步法DNB制備試劑等組分,簡單易用
時空文庫專屬
時空文庫專屬
專為STOmics時空組學文庫設計,可適配時空轉錄組FFPE文庫(V1.0),即將適配時空轉錄組FF文庫(V1.3)
雙平臺適配
雙平臺適配
搭配時空組學建庫流程,適配DNBSEQ-T7RSMGISEQ-2000RS,提供卓越的測序性能
一體化集成
一體化集成
高度集成試劑盒,內置時空測序引物和一步法DNB制備試劑等組分,簡單易用
時空文庫專屬
時空文庫專屬
專為STOmics時空組學文庫設計,可適配時空轉錄組FFPE文庫(V1.0),即將適配時空轉錄組FF文庫(V1.3)

性能參數


MGISEQ-2000RS 時空可視化試劑套裝
DNBSEQ-T7RS 時空可視化試劑套裝
讀長
PE75
PE75
載片類型
FCL
FCL
載片流道數
4 1
最大reads數*/載片
1280 M~1800 M
3500 M~5800 M
數據質量Q30**
>85%
>85%
運行時間
22 h*** 12 h****

*有效reads數值根據特定時空文庫運行所得,實際應用文庫受樣本類型、建庫方式會有所波動。
**高于Q30的堿基百分比及運行時間是特定時空文庫通過整個運行平均所得。實際應用表現(xiàn)受樣本類型、文庫質量、插入片段長度等因素影響。

***運行時間根據雙載片模式進行統(tǒng)計,包括:樣本加載、測序、堿基識別和數據處理時間(從Post loading prime到FASTQ文件輸出)。

****運行時間包括載片上機、測序、生成Cal.文件等。Cal.是由華大智造測序儀軟件生成的二進制文件格式。


一體化集成試劑盒,助力時空組學測序


華大智造時空可視化試劑套裝高度集成,內置時空測序引物和一步法DNB制備試劑等組分,提高試劑套裝的易用性。同時,時空可視化試劑套裝采用全新一代化學試劑StandardMPS 2.0,提升數據質量,助力時空轉錄組FFPE產品方案全流程。

本試劑套裝僅供研究使用,不得用于診斷或治療。


推薦方案

時空轉錄組FFPE產品方案,利用“隨機探針”對FFPE樣本中組織細胞內的Total RNA分子進行原位捕獲,并通過空間條形碼(Coordinate ID,CID)還原回空間位置,可實現(xiàn)全物種全轉錄組空間表達圖譜的構建,助力臨床科研深入理解疾病的發(fā)生與發(fā)展機制。與常見轉錄組方案相比,該方案可以捕獲發(fā)生降解的RNA片段,也能實現(xiàn)編碼及非編碼RNA的共捕獲,以及宿主與微生物的共檢測。


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