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【智造微課】CoolMPS到底有多酷?
時間:2020-04-17作者:華大智造閱讀數(shù):13392分享

第一期智造微課為您全方位講解了“CoolMPS到底有多酷”,下文將為您梳理CoolMPS課程干貨。


CoolMPS為什么酷?

錯配率作為高通量測序中測序數(shù)據(jù)質(zhì)量的重要反映指標(biāo),反映著測序質(zhì)量的優(yōu)劣。通過與其他平臺的對比,可以驚喜發(fā)現(xiàn),華大智造MGISEQ-2000 CoolMPS測序數(shù)據(jù)的Mismatch rate隨cycle數(shù)的變化,始終維持在一個較為平穩(wěn)的低值。



CoolMPS技術(shù)原理

CoolMPS測序過程,即首先引入未標(biāo)記可逆終止核苷酸,隨后使用熒光標(biāo)記的能與3'-阻斷的核苷酸特異結(jié)合的抗體進(jìn)行堿基識別。切除3'-阻斷基團(tuán)后,結(jié)合的抗體從核苷酸上掉落下來,再生天然核苷酸,由此形成循環(huán)往復(fù)。



這種恢復(fù)到天然核苷酸的特性允許在新的測序循環(huán)中進(jìn)一步延伸,而不受前一個循環(huán)的任何干擾。此外,無標(biāo)簽的RTs(可逆終止子)更容易制備,可以更有效的被聚合。另一個優(yōu)點是與標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)記RTs的單個染料相比,抗體可以攜帶同一染料的多個分子,從而大大增加了測序信號。



CoolMPS用戶數(shù)據(jù)

以CoolMPS國內(nèi)用戶在WGS、WES和腫瘤Panel等應(yīng)用的實測數(shù)據(jù)為例,基于DNBSEQ平臺的CoolMPS測序結(jié)果顯示,平均Q30至少提升了5%,Mismatch rate降低了50%以上,能夠檢測到更多突變位點,而且對于超低頻突變的標(biāo)準(zhǔn)品測試驗證結(jié)果優(yōu)秀(檢出率高達(dá)92.3%)。












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