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【智造微課】DNBSEQ-T7高能篇 · 超高通量
時間:2020-04-20作者:華大智造閱讀數:17777分享


作為全球日生產能力最強的基因測序儀,DNBSEQ-T7已獲得NMPA認證和CE-IVD認證,同時提供全流程自動化產品組合。本期回顧,將與大家一起對這臺超級性能怪獸進行360度圍觀。


超級通量模式:1-6Tb

生產級的DNBSEQ-T7通量驚人,單張載片最大有效reads數可達5000M,最大數據量達1.5Tb,四載片連載日產數據量高達6Tb,廣泛適用于全基因組測序(60例/天)、超高深度外顯子組測序(400例/天)、宏基因組測序(1000例/天)、腫瘤Panel測序(6000例/天)等大型測序項目。


*單張載片產生的數據量與測序模式相關


超級運行模式:1-4張載片,獨立運行

DNBSEQ-T7擁有4聯載片平臺,靈活支持1-4張載片獨立運行:每張載片在上機后可自動完成清洗和回收,能夠在24小時內無縫銜接多輪測序。


[1]SE50面向新冠疫情特別開發,限量供應,優先滿足新冠病毒基因檢測需求

[2]PE150將于2020年6月底上市

*高于Q30的堿基百分比及運行時間是特定標準文庫通過整個運行平均所得,實際應用表現受樣本類型、文庫質量、插入片段長度等影響。


超級速度模式 

SE50~5小時 

PE100~20小時,PE150~24小時

以新冠病毒基因測序為例,DNBSEQ-T7使用SE50進行新冠病毒測序,5~6個小時可完成一輪測序,如高通量宏基因組測序(100M reads/樣本),每輪可檢測~128例樣本,每天可做4輪檢測;再如多重測序篩查(5M reads/樣本),每輪可檢測~2300例樣本,每天可做3輪檢測,日檢測通量近萬。


一站式產品:端到端

圍繞DNBSEQ-T7,華大智造提供全面的自動化產品組合。在上游的樣本前處理方面,可適配華大智造自動化樣本制備系統MGISP系列(MGISP-960/MGISP-100);在下游的計算存儲方面,華大智造推出了集計算、存儲和分析軟硬件為一體的“T7伴侶”:ZTRON生信自動化服務平臺。在整體的實驗室管理方面,華大智造ZLIMS實驗室信息管理系統提供端到端的應用產品。




數據表現:優秀

DNBSEQ-T7的數據表現一直是業內關注的焦點,目前已支持10余種不同文庫和測序類型,包括WGS、WES、WGBS等常見庫類型,及stLFR、RNA、單細胞等特殊文庫類型。此外,在DNBSEQ-T7平臺上,對不同類型的文庫混合、單雙INDEX混合進行了測試,數據結果表現優異


*DNBelab C系列單細胞RNA文庫制備套裝近期上市



溫馨提示:

部分原始數據可點擊華大智造官網菜單欄“支持”,進入“Demo”選項自行下載分析。


已發表文章:靠譜

韓國基因組學中心(KOGIC)等機構在BioRxiv發布了基于DNBSEQ-T7的多平臺測序性能對比研究,結果表明:華大智造DNBSEQ測序平臺和其他平臺在測序質量、覆蓋均勻性、GC覆蓋度和變異準確性方面均有可比性,且相較之下更具成本優勢



倫敦帝國理工學院傳染病流行病研究中心,濰坊疾控中心等單位基于DNBSEQ-T7的基因組數據用于對濰坊市28例新冠病毒陽性樣本進行測序,基于數據分析建立了流行病學系統模型,對基因組流行病學的研究提供了地域依據。



溫馨提示:

DNBSEQ-T7已獲得NMPA認證和CE-IVD認證。








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