以下文章來源于MDx News ,作者Lemon
IDD 2021第二屆感染性疾病診斷技術創新論壇(2021年7月15-16日·武漢)組委會有幸在大會前采訪到華大智造高級副總裁、青島華大智造總經理 倪鳴博士,并在本次采訪中分享了華大智造測序平臺的核心技術、創新產品及應用優勢。

倪鳴博士,華大智造高級副總裁、青島華大智造總經理。作為最早加入華大自主測序平臺硬件研發成員,從2013年至今參與了多個華大測序技術平臺的搭建。
IDD 2021組委會:
倪博好,您從2013年至今參與了多個華大測序技術平臺的搭建,可以給我們簡單介紹一下么?
倪鳴:
2013年我們收購了美國CG公司,之后我們在研發層面圍繞DNBSEQTM核心技術做了諸多優化和升級。升級后的DNBSEQTM技術在準確率和數據利用率上具備顯著的優勢。
在DNBSEQTM技術中,我們采用滾環復制擴增的方式,對DNA信號進行放大,無錯誤累積,使得華大智造測序平臺具備更高的準確率、更低的Dup率(Dup率越低數據利用率越高)。同時,我們在光學、機械、電子、流體、算法等方面通過持續的技術升級與迭代,使得測序技術不斷提升。
依托DNBSEQTM核心技術,華大智造陸續推出了中高通量基因測序儀MGISEQ-2000、中通量基因測序儀MGISEQ-200、高通量基因測序儀DNBSEQ-T7,以及超高通量測序系統DNBSEQ-Tx系列,能夠滿足不同類型的用戶在各自應用場景中的使用需求,逐漸收獲了來自全球用戶的認可和好評。這次,我們將要帶來最新的便攜式基因測序儀DNBSEQ-E5,最快可4.5個小時輸出下機數據(測序讀長:SE50),對特殊樣本的緊急測序需求能夠給予即時響應,是我們對更小通量的基因測序儀產品的全新嘗試。
IDD 2021組委會:
關于您提到的DNBSEQ-T7,是一款高通量的基因測序儀,那么這次帶來的DNBSEQ-E5便攜式基因測序儀是一款什么樣的機型?
倪鳴:
基因測序儀是我們認識生命、認識世界的一個工具。DNBSEQ-T7以及我們在此基礎上推出的DNBSEQ-Tx系列超高通量測序系統,加快了百萬級、千萬級的大人群基因組研究的推進。同時,我們也意識到應該進一步的降低基因測序儀的入門門檻,使基因測序技術和現在大家都比較熟悉的核酸檢測技術一樣,成為更普遍的工具之一。為此,我們在2019年發布DNBSEQ E系列測序儀并開放機型定制化。DNBSEQ E系列測序儀單機和一臺筆記本電腦占用的桌面面積差不多,一名實驗人員一只手就可以拎起來、抱著走,也不需要額外準備嚴格溫濕度控制的實驗室空間,實驗操作很簡單,十分鐘之內就可以完成準備工作開始運行,進行現場測序。
這次會議上我們將要帶到現場來的DNBSEQ-E5便攜式基因測序儀是華大智造E系列基因測序儀首款面向終端用戶上市的標準化產品。可以滿足小型全基因組測序、靶向測序、病原微生物檢測等多種應用需求。
IDD 2021組委會:
那么與華大智造基因測序儀的其他機型相比,這款E系列基因測序儀有哪些創新點?
倪鳴:
基于華大智造DNBSEQTM核心技術獨有的技術優勢,E系列基因測序儀采用了更加集成化的設計方案,測序載片集成了微流控液路系統和信號采集模塊,與測序試劑盒匹配使用,測序試劑不經過儀器液路系統直接進行生化反應。
此外,在測序生化原理方面,E系列基因測序儀采用了全新的自發光體系,可以讓測序載片實時讀取堿基信號并轉化為序列信息。基于以上兩點,華大智造E系列基因測序儀本身不再需要配備傳統的光學以及流體系統,體積更小,重量更輕、測序速度更快。
IDD2021組委會:
作為E系列基因測序儀的首款標準化機型,DNBSEQ-E5便攜式基因測序儀在實際應用中可以發揮哪些優勢作用?
倪鳴:
作為一款入門級的基因測序儀, DNBSEQ-E5便攜式基因測序儀是廣大科研用戶初次嘗試測序的首選機型。同時,對于深耕測序領域的行業客戶而言,DNBSEQ-E5便攜式基因測序儀以其小巧、靈活的特點,可以成為現有機型的“后備隊員”,可隨時上場,即開即用、隨到隨測。
以DNBSEQ-E5便攜式基因測序儀在新冠疫情期間試運行的表現為例,該機型可以部署在常規的核酸檢測實驗室現場,其大小與PCR儀相當,一旦發現疑似陽性樣本,可以立即安排上機測序,最短10個小時就可以完成測序并直接輸出病毒溯源的結果(測序讀長:SE100)。
IDD2021組委會:
在疫情中,以華大智造為代表的中國企業發揮了哪些重要作用?
倪鳴:
面對疫情反復、多點散發,針對大人群的群防群控、精準檢測,以及深入開展的溯源研究都很重要。將疫情防控落實到位,需要做好能力建設和技術儲備。
首先,華大智造的高通量測序技術在發現新病原、識別已知病原及鑒定未知病原等方面發揮關鍵作用。其自主研發的高通量測序儀DNBSEQ-T7、MGISEQ-2000、MGISEQ-200奔赴國內外疫情一線,與疾控中心和科研機構等單位展開緊密合作。
其次,面對多點散發、來勢兇猛的疫情,華大智造研發了一系列實驗室自動化設備。這些設備可以全自動掃描、錄入、分裝樣本,自動提取核酸。整個實驗過程都可以通過實驗室管理系統實時監控管理,提升了大規模核酸檢測的效率、保障了檢測人員的安全。
特別關注
深圳華大智造科技股份有限公司,領域產品經理徐媛、高級產品經理張陸琪即將出席7月15-16日在武漢舉辦的IDD 2021第二屆感染性疾病診斷技術創新論壇,并分別在現場針對“華大智造核心科技助力新型冠狀病毒防控”和“DNBSEQTM測序平臺在病原方向的應用與實踐”這兩個話題進行各自深度分享。屆時有展位展示,展位號A1。敬請關注。
會議期間特設會場至華大智造客戶體驗中心(武漢)參觀路線,您可通過掃描下方二維碼的方式預約參觀,將有機會步入華大智造客戶體驗中心,參觀DNBSEQTM主題館、集裝箱式移動實驗室平臺體驗區、DNBSEQTM測序平臺體驗區和病原高通量測序一站式平臺體驗區,并由領域技術專家帶您了解華大智造的技術、產品以及發展近況。
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