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華大智造攜手10x Genomics:單細(xì)胞RNA測序技術(shù)不止步!

時間:2019-05-22作者:華大智造閱讀數(shù):9780分享

2019年5月20-22日,華大智造受邀參加由日本理化學(xué)研究所(RIKEN)在日本東京主辦的歐洲分子生物組織(EMBO)單細(xì)胞生物學(xué)研討會。5月21日,華大智造聯(lián)合RIKEN獻(xiàn)上了一場精彩的衛(wèi)星會。會議期間,華大智造宣布將與10x Genomics 公司共同致力于為用戶提供單細(xì)胞測序的完整平臺。

華大智造利用其全新的文庫轉(zhuǎn)換技術(shù)與10x Genomics 的 Chromium系統(tǒng)相配合,最終達(dá)成了10x Genomics 公司的單細(xì)胞測序技術(shù)與MGISEQ平臺及BGISEQ平臺完美兼容。


目前,基于華大智造測序平臺產(chǎn)出的單細(xì)胞RNA數(shù)據(jù)已分別被英國Wellcome Sanger研究所和位于澳大利亞悉尼的Garvan醫(yī)學(xué)研究所所驗證。兩項研究均旨在評估華大智造與市面其他同類產(chǎn)品在單細(xì)胞RNA測序技術(shù)方面的表現(xiàn)。分析結(jié)果表明,華大智造產(chǎn)出的測序數(shù)據(jù)具有可比性,且成本更低。華大智造獨有的DNBSEQTM技術(shù)具有高準(zhǔn)確性、低重復(fù)序列率、低標(biāo)簽跳躍的重要特性,可始終擴增原版DNA,避免錯誤積累,并兼具測序信號強度和準(zhǔn)確性,以實現(xiàn)最高效準(zhǔn)確的大規(guī)模并行測序。


華大智造首席運營官蔣慧表示:“基于DNBSEQTM的測序技術(shù),單細(xì)胞RNA測序在華大智造平臺上的數(shù)據(jù)表現(xiàn)十分出色,相信與10x Genomics 公司的合作將為客戶提供更有價值的技術(shù)平臺解決方法。我們的文庫轉(zhuǎn)換技術(shù)也將在未來有更廣闊的應(yīng)用,現(xiàn)在僅僅是個開始。”


在5月21日的智造衛(wèi)星會議上,來自英國Wellcome Sanger 研究所的Sarah Teichmann 博士和 Kedar Natarajan博士也展示了今年4月份發(fā)表在Genome Biology 的研究成果【1】。該項研究分析基于DNBSEQTM技術(shù)的華大智造測序平臺數(shù)據(jù)表現(xiàn)優(yōu)異,與Illumina 相當(dāng)。


早在今年2月份,另外一項研究也得出了類似的結(jié)論。Garvan 醫(yī)學(xué)研究所與華大團隊共同分析了在10x Genomics 平臺上的7萬多個單細(xì)胞,并使用MGISEQ-2000,Illumina NextSeq 500和NovaSeq 6000進(jìn)行測序。研究結(jié)果表明,MGISEQ-2000和NovaSeq的數(shù)據(jù)具有可比性,而MGISEQ-2000的表現(xiàn)優(yōu)于NextSeq 500,可以識別更多的細(xì)胞、基因和UMI,該項研究結(jié)果已于今年2月份公開發(fā)布在BioRxiv上【2】。


2018年1月,華大智造在10x Genomics公司的Compatible Certification Program中共同探索單細(xì)胞測序技術(shù)。一年多的時間過去,越來越多的實驗結(jié)論已經(jīng)證實了華大智造測序平臺的表現(xiàn),我們也能十分清晰地看到,MGISEQ與BGISEQ 測序平臺已展示出其開放性與兼容性,同樣的,10x Genomics平臺也是如此。


華大智造提供的單細(xì)胞生物學(xué)兼容解決平臺證明了其 DNBSEQ文庫與市面上現(xiàn)有的測序應(yīng)用可以兼容,相信未來華大智造也絕不會止步于此,將持續(xù)推動創(chuàng)新,不僅對其他的單細(xì)胞生物技術(shù)兼容,而且通過其通用轉(zhuǎn)換技術(shù)為腫瘤檢測、外顯子測序和傳染感染疾病檢測提供有效且經(jīng)濟實惠的平臺。


參考文獻(xiàn)

[1] Kedar Nath Natarajan etal. Comparative analysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics【J】Genome Biology,2019

[2] Anne Senabouth etal.Comparative performance of the BGI and Illumina sequencing technology for single-cell RNA-sequencing[J]bioRxiv,2019

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