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華大“全讀長”測序儀系列助力中國疾控中心預防控制艾滋病

時間:2024-12-01作者:華大智造閱讀數:7243分享

據新華社報道,在第37個世界艾滋病日前夕,中共中央政治局委員、國務院副總理劉國中到中國疾控中心調研艾滋病防治工作,看望慰問一線防治工作者和相關科研人員。他強調,要深入學習貫徹習近平總書記重要指示精神,落實黨中央、國務院決策部署,創新醫防協同、醫防融合機制,壓實各方責任,健全服務體系,扎實做好艾滋病防治各項工作,持續提升防治成效,為增進人民群眾健康福祉提供有力保障。


不久之前,中國疾病預防控制中心性病艾滋病預防控制中心(以下簡稱“中國疾控艾防中心”)病毒免疫室使用華大智造MGISEQ-2000高通量測序儀和華大序風CycloneSEQ-WT02納米孔測序儀,對HIV病毒近全長擴增子進行了測序分析,鑒定出新的HIV-1CRF分枝CRF172 0755,并提供了該重組型的詳細信息。這對于制定有效的艾滋病防控策略至關重要,并為理解HIV-1在中國MSM(男男性行為)群體中的傳播和進化提供了新的洞察。值得一提的是,通過將CycloneSEQ納米孔測序儀與DNBSEQ高通量測序儀結合使用,研究團隊組裝了完整的HIV近全長基因組,為鑒定HIV超感染或新型重組病毒提供了可靠的方法學支撐。



HIV-1CRF分枝CRF172 0755近全長基因組


HIV超感染是指HIV感染者再次感染了一種新的、在系統發生學上與可檢測到的病毒毒株不同的病毒毒株, 兩種不同的HIV毒株可以進入同一細胞,通過交換基因片段形成新的重組病毒。這種情況可能與初次感染一樣常見,并且不限于高風險人群。多重感染即使在之前已經控制了HIV感染的人群中也會發生,它可能會降低治療的臨床療效,加快病情發展,并增加HIV抗藥性。通過檢測超感染患者體內HIV毒株的基因序列,可以了解HIV毒株的來源重組情況、傳播路線等,這對理解HIV的傳播模式、毒株的變異和進化具有重要意義,也為艾滋病耐藥監測和感染溯源提供支撐。



HIV超感染傳播模式示意圖


基因測序技術能夠提供大量的核酸序列信息,可以覆蓋HIV基因組的近全長,能更準確地識別和區分HIV的不同亞型和準種以及多種藥物的耐藥位點。相比于傳統的PCR產物克隆法和終點有限稀釋PCR法,基因測序技術操作更為簡便、檢測成本較低。不僅如此,基因測序技術還具有高靈敏度,能夠檢測到低豐度的病毒變異,對于監測病毒的變異和演化具有重要價值,有助于病毒的溯源調查、耐藥監測以及輔助臨床診斷和治療。


HIV超感染的鑒定之外,HIV-1耐藥監測也是全球艾滋病防控的重要組成部分,隨著抗病毒治療的廣泛實施,HIV耐藥性問題逐漸成為影響治療效果的關鍵挑戰。基因測序設備的應用能夠使耐藥突變檢測更加高效精準,為艾滋病抗病毒治療提供有力支持;同時,結合自動化建庫設備的使用,可實現樣本處理全流程自動化,大幅減少人工操作時間,提升一致性和效率,為耐藥檢測在各級疾控中心的日常應用和臨床普及奠定基礎。


去年,華大智造基于自主研發的文庫制備試劑、自動化樣本制備系統、DNBSEQ測序儀以及分析軟件發布了HIV-1耐藥測序組合產品,實現從病毒RNA到報告全流程覆蓋,可對樣本中的HIV-1病毒進行快速、精準的耐藥檢測和分型,賦能艾滋病耐藥監測與流行病學研究。截至目前,該組合相關設備已陸續被引入國家疾控及廣東、廣西、四川、貴州、上海等多個地方疾控中心。



HIV-1耐藥測序組合產品全流程


同時,華大智造已展開研發基于CycloneSEQ平臺的HIV全長基因組測序組合產品,將充分結合納米孔基因測序儀長讀長的優勢,實現更準確地識別不同亞型和準種,更深入地理解HIV的遺傳多樣性和病毒變異,為識別HIV超感型別提供更靈敏、更準確、更全面的工具支撐。


華大智造是全球少數幾家能夠自主研發并量產從Gb級至Tb級低中高不同通量的臨床級基因測序儀企業之一, 也是全世界唯一擁有激發光、自發光、不發光三種不同技術路徑測序儀的公司。在公共衛生領域,華大智造已形成病原微生物宏基因組測序、靶向測序、全基因組測序等應用場景的全流程產品組合,通過研發創新持續為公共衛生事件的監測和預警提供更自動、更便捷、更高效的自主核心工具。


未來,華大智造將繼續發揮工具的創新力量,在改善人類健康之路上與全球生態伙伴緊密合作,提供覆蓋長短讀長的完整測序解決方案,持續推動基因測序速度、讀長、準確率及測序成本等各個關鍵指標突破,讓基因測序更可及、讓生命皆可測,讓科技創新實實在在服務于人類的健康和福祉。

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