通過對mRNA轉(zhuǎn)錄組測序，可以檢測基因表達(dá)差異，發(fā)現(xiàn)未知轉(zhuǎn)錄本和稀有轉(zhuǎn)錄本，精確地識別可變剪切位點(diǎn)、基因融合、SNP以及Indel位點(diǎn)等。通過對非編碼RNA測序，例如長鏈非編碼RNA（lncRNA）和小RNA（Small RNA）等，可以鑒定和預(yù)測相應(yīng)非編碼RNA的種類和含量以及其靶基因，可用于腫瘤調(diào)控和發(fā)生發(fā)展研究。